某企业2019年7月发生研发费用75万元，该企业在申报预缴企业所得税时，将75万元的研发费加计扣除了。该企业主管税务机关认为，研发费用加计扣除只能在企业所得税汇算清缴时享受，预缴税款时不能加计扣除，应调增当期应税所得额，补缴企业所得税。
企业所得税法第三十条规定，企业为开发新技术、新产品、新工艺而发生的研究开发费用支出，可以在计算应纳税所得额时加计扣除。所得税法实施条例第九十五条进一步明确，企业开展研发活动中实际发生的研发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按规定据实扣除的基础上，按照本年度实际发生额的50%，从本年度应纳税所得额中扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的150%在税前摊销。而且，企业所得税按纳税年度计算，分月或者分季预缴，自年度终了之日起5个月内，报送年度企业所得税纳税申报表，并汇算清缴，结清应缴应退税款。
《国家税务总局关于发布〈中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（2019年版）等报表〉的公告》（国家税务总局公告2019年第31号）附表1《不征税收入和税基类减免应纳税所得额明细表》第30行“新产品、新工艺、新技术研发费用加计扣除”填表说明：填报纳税人根据企业所得税法和相关税收政策规定，发生的新产品、新工艺、新技术研发费用加计扣除的金额。该企业认为，按照该预缴申报表的栏次设置和填表说明，表明“新产品、新工艺、新技术研发费用”在预缴企业所得税时可以加计扣除。
税务机关认为，《财政部、国家税务总局、科技部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》（财税〔2019〕119号）全面规范了企业研发费用税前加计扣除的操作规程及相关要求，虽然未对预缴所得税是否允许研发费用加计扣除进行明确，但对研发费用加计扣除的企业类型、财务核算、费用归集、条件范围、备案管理等作了具体规定，且研发费每个月、每个季度都可能发生变化，企业所得税预缴时很难完整、规范核算，故只能据实扣除但不能加计扣除，而应等到汇算清缴时准确核算研发费相关项目后才能加计扣除。
国家税务总局关于《企业所得税优惠政策事项办理办法》的公告（国家税务总局2019年第76号公告）附件1《企业所得税优惠事项备案管理目录（2019年版）》规定，开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用加计扣除只能“汇缴享受”，预缴企业所得税时不能享受该项优惠。为此，上述企业发生的研发费不能在其预缴企业所得税时加计扣除。
所以，根据上述政策，享受研发费用加计扣除优惠的纳税人，应自行判断和计算可享受的加计扣除优惠，在办理企业所得税年度汇算清缴纳税申报时，应按照规定的程序和操作要求计算加计扣除，防止出现涉税风险。
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